预算管理常见的问题主要有以下几个方面：
预算制订
目标制定的不合理，太高达不到，太低没有激励性。
各部门编制的计划比较零散，部门内部和部门之间的计划缺乏协调性，容易发生公司资源分配的冲突。
预算编制缺乏依据，成本预算没有按照成本动因进行分解，单纯依靠历史数据和主观判断。
预算确定的目标与各负责人员的职责不相匹配。
企业不能根据自身条件选择适合的预算方法，盲目实施复杂的预算解决方案，无法确认编制订预算所需的投入，预计投入人力和时间过于漫长。
预算执行常见的问题
预算执行监控：
监督跟踪不到位，没有相应的配套措施。
预算中一些费用分摊方法为各管理人员无法控制。
没有预算作为依据，支出审批时不能区分正常的和例外的支出，高管人员不得不应付大量日常审批事务，审批程序复杂周期长，无法适应复杂多变的环境要求。财务部门在对支出审批上不能起到有效的监督作用。
缺乏相应的预算考核制度。造成企业预算的编制与执行相脱离，重编制、轻执行。预算不能成为企业的“硬约束”，使预算失去其应有的权威性和严肃性，部门绩效考核缺乏基础和比较对象。
在分析预算执行情况时，仅将预算值与执行情况进行简单的比例计算，而没有对预算差异进行深入的、定量的分析，难以确定预算差异产生的原因，无法把预算执行情况与企业经营状况有机的联系在一起。
